Dzimis 1959.gada 7.aprīlī Liepājā

Studējis  Emīla Melngaiļa mūzikas vidusskolā, Jāzepa Vītola Latvijas Valsts Konservatorijā. 

Grupas “Zodiaks”izveidotājs un dalībnieks. Pirmais albums “Disco Alliance” (1980) kļūst par Latvijas un  par visas Padomju Savienības hītu, sasniedzot rekordlielu tirāžas skaitu – 20 miljoni. Pēdējo reizi grupa sanāk kopā 1996. gadā, kad iznāk albums “Dedication”.

Paralēli grupas darbībai 1985. gadā Jānis Lūsēns sevi piesaka teātra mūzikas žanrā, sarakstot mūziku Jevgēnija Jevtušenko poēmas “Māte un neitronbumba” iestudējumam Liepājas teātrī. Teātra mūzika komponista daiļradē gadu gaitā kļuvusi par nozīmīgu un neatņemamu sastāvdaļu. Milzīgu publikas interesi un mīlestību iemanto rokopera “Kaupēn, mans mīļais”. 2008. gadā rokopera tiek ierakstīta izcilāko un ievērojamāko mākslas darbu vidū, kas atspoguļo latviešu nācijas raksturojošās vērtības, veidojot Latvijas kultūras kanonu.

Par savdabīgām rekordistēm kļuvušas “Putnu opera”, kuru tās deviņu izrādīšanas gadu laikā noskatās vairāk nekā 95 tūkstoši skatītāju, un “Sfinksa”, kuru astoņu gadu laikā noskatās aptuveni 90 tūkstoši skatītāju, savukārt 2001. un 2002. gadā Latvijas teātros vienlaicīgi tiek spēlētas piecas viņa muzikālās izrādes. 

Jāņa Lūsēna muzikālās izrādes un operas kopā noskatījušies aptuveni 450’000 skatītāju. 

J.Lūsēns darbojas arī akadēmiskās mūzikas žanrā, sarakstot kantātes un simfonijas koriem. Kopdarbā ar dzejnieci Māru Zālīti radīti vairāk kā 10 muzikāli dramatiski darbi.

 90. gados J. Lūsēns nopietni pievērsies arī vokāli simfonisko darbu rakstīšanai (kantāte LIIV, Magnificat, kora simfonija Dziļā elpā). J. Lūsēna dziesmas vairāk kārt skanējušas Vispārējos latviešu dziesmu svētkos un Skolēnu dziesmu svētkos. 1998. gadā Liepājā noticis komponista autorkoncerts “ Kā maigi dzelošs rožu krūms” . 

Saņēmis Latvijas teātru gada balvu kā labākais komponists 

(1996 – par mūziku izrādei Santa Krusa, 1999 – par rokoperu Kaupēn, mans mīļais), AKKA/LAA Autortiesību bezgalības balvu 2003  un augstāko Latvijas valsts apbalvojumu mūzikā – Lielo Mūzikas balvu 2001.gadā (par muzikālajām izrādēm 2000. gadā un devumu teātra mūzikas žanrā). 

Kopš 1987. gada J. Lūsēns ir Latvijas Komponistu Savienības biedrs.

Triju Zvaigžņu ordeņa virsnieks (2009).